A Fundação Muraki foi criada em 13 de julho de 1999 como uma instituição de direito privado sem fins lucrativos, com o objetivo de servir no apoio institucional do Instituto de Tecnologia da Amazônia (UTAM), tendo como Diretor Fernando dos Santos Moreira Junior e o seu registro na Provedoria das Fundações do Ministério Público do Estado do Amazonas.
A partir de 14 de julho de 2003, Paulo Adroaldo Ramos Alcantara assumiu a direção da Fundação Muraki, onde veio a falecer em outubro de 2020.
Em 2021, iniciou o projeto Ação Solidária que realiza a doação de cestas básicas a abrigos e entregas de refeições nos hospitais e pessoas necessitadas.
Após a extinção da UTAM, em 2001 passou a apoiar a Universidade do Estado do Amazonas (UEA), na gestão e apoio administrativo nos projetos de pesquisa, extensão, cursos e P&D.
Fernando Moreira retornou à direção da instituição, dando andamento nas atividades realizadas pela Muraki através do Programa Prioritário de Formação de Recursos Humanos, com projetos sociais, internacionais e com novas propostas de gestão e parceiros.
Durante os 22 anos, a Muraki apoia e participa da gestão de projetos de ensino, pesquisa, desenvolvimento e inovação tecnológica no âmbito regional, nacional e internacional, bem como projetos sociais e filantrópicos.
Apoiar no gerenciamento de projetos de ensino, pesquisa e extensão da Universidade do Estado do Amazonas e de outras instituições na Região Norte do país.
Ser referência na região norte como gestora de projetos até 2024.